Líneas y Grupos de Investigación

 

 

Grupo de Investigación en Ciencias Básicas Médicas

 

Grupo de Salud Pública

 

Grupo de Investigación en Neurociencias (NEUROS)

 

Grupo de Genética Humana

 

Grupo de Investigación en Educación Médica

 

Grupo de Investigación en Aspectos Clínicos y Moleculares de las Enfermedades Infecciosas

 

Grupo Bio-Bio  

 

Grupo de Investigación en Rehabilitación e Integración Social de la Persona con Discapacidad

 

Centro de Estudio de Enfermedades Autoinmunes (CREA)

 

 

GRUPOS Y LÍNEAS DE INSTITUCIONES ASOCIADAS

 

 

CENTRO INTERNACIONAL DE FÍSICA

 

 

GRUPO DE INVESTIGACIÓN BIOFÍSICA Y BIOLOGÍA DE MEMBRANAS
Cuenta con las siguientes líneas de investigación:

 

 

Propiedades de Membrana en el Modelo Leishmania - macrófago y otros Modelos

 

Mediante técnicas de electrofisiología y biología molecular, se estudia la interacción Leishmania-macrófago para explicar cómo este parásito logra superar los cambios de ambiente durante su ciclo de vida, en su tránsito desde el medio alcalino del intestino de su vector invertebrado hasta un compartimiento intracelular ácido en su célula hospedera mamífera (macrófago), manteniendo homeostasis iónica, volumen, osmolaridad y pH, procesos relacionados tanto con la estructura como la funcionalidad de la membrana celular.

 

 

Así mismo, esperamos establecer la especificidad de los cambios encontrados o sugerir los cambios en las propiedades de la membrana y el tráfico vesicular que suceden en un macrófago como consecuencia de la fagocitosis de volúmenes grandes.

 

 

De esta manera se busca contribuir al conocimiento básico de la leishmaniosis y en la búsqueda de nuevos blancos terapéuticos.

 

 

Integrantes

• Martha Lucía Posada Buitrago Ph.D,

 

 

 

CORPORACIÓN PARA INVESTIGACIONES BIOLÓGICAS (CIB)

 

 

GRUPO DE INVESTIGACIÓN BIOLOGÍA CELULAR E INMUNOGENÉTICA
Cuenta con las siguientes líneas de investigación:

 

 

Línea de investigación en Biología molecular de las micosis

 
Esta línea de investigación es fundamentalmente de carácter básico y tiene como objetivo lograr una mejor comprensión de la Paracoccidioidomicosis (PCM) a partir del estudio de las bases moleculares que rigen la biología del hongo, su ciclo de vida, sus factores de virulencia y su relación con el hospedero.

 

 

Dentro de la línea de investigación se ha logrado identificar una proteína antigénica (27 kDa, P27), promisoria para el diagnóstico de la PCM, y las proteínas HSP90 y HSP70 de P. brasiliensis y su relación con el dimorfismo térmico del hongo, como unos de los principales factores de virulencia.

 

 

Se han reconocido 3 especies filogenéticas en P. brasiliensis basados en los estudios bioinformáticos realizados y su importancia en las diferencias fenotípicas (virulencia y dimorfismo). Se han identificado marcadores genéticos sexuales en P. brasiliensis (Genes del sistema de apareamiento MAT1-1 y MAT 1-2) y su relevancia en la taxonomía, reproducción sexual y virulencia del hongo.

 

 

Dentro de esta línea de investigación se han desarrollado proyectos en el área de genómica con los cuales se ha logrado la implementación de tecnología de punta en biología molecular incluyendo:

 

• El clonaje de genes
• Secuenciación
• Obtención de librerías tanto genómicas como de ADNc
• La expresión de proteínas recombinantes
• La amplificación de genes por Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR)
• La evaluación de expresión de genes por PCR en tiempo real
• Un sistema de transformación en P. brasiliensis 
• La creación de cepas mutantes con expresión disminuida en diversos genes “knockdown” en P.brasisliensis.

 

Los proyectos en el área de filogenética y genómica comparativa han llevado al desarrollo del área bioinformática, con la implementación y uso de programas básicos para alineación de secuencias (Clustal), para el diseño de iniciadores (primers) de PCR convencional, qPCR y clonación (Primer Express), uso de paquetes bioinformáticos para análisis de secuencias (por ejemplo, GENEIOUS Pro) y análisis de similitud de las secuencias por el algoritmo BLAST, así como la construcción de genealogías/arboles filogenéticos (por ejemplo máxima parsimonia por PAUP y parsimonia estadística por TCS).

 

 

En proyectos recientes en el área bioinformática para el análisis de P. brasiliensis se presenta una propuesta que permitirá aprovechar el poder de la genómica comparativa para identificar los factores de virulencia posibles, además que dada la reciente disponibilidad de otros genomas del hongo, nos permitirá analizar genes candidatos para la selección positiva y singularidades de la cepa local.

 

 

Se realizarán secuenciaciones de los genomas para iniciar los montajes y aplicar las metodologías de bioinformática moderna. Una vez ensamblado, el análisis comparativo podría aportar pruebas para apoyar o refutar los genes candidatos de patogenicidad, así como proponer otros nuevos.

 

 

Dada la naturaleza de este proyecto, se diseñará una base de datos bioinformática que provea información a la comunidad científica ofreciendo datos genómicos de acceso público.

 

  

FUNDACIÓN INSTITUTO DE INMUNOLOGÍA DE COLOMBIA (FIDIC)

 

 

Línea de Biología Molecular y Bioquímica de Parásitos

 
El objetivo de está línea de investigación está orientado a generar conocimiento básico acerca de las interacciones entre el parásito productor de malaria Plasmodium vivax y su hospedero humano. A mediano plazo, se busca desarrollar una vacuna efectiva basada en subunidades contra este patógeno.

 

 

Dentro de los diferentes subproyectos que están en curso para lograr el objetivo, se encuentran:

 

• El estudio de la variación genética de las proteínas parasitarias.
• La identificación de nuevos antígenos mediante bioinformática y biología molecular.
• La expresión y purificación de los antígenos candidatos a vacuna como proteínas recombinantes.
• La evaluación del grado de protección y respuesta inmune generada en monos Aotus spp. ante la inoculación de los candidatos vacunales.

 

La Línea de Investigación de Biología Molecular y Bioquímica de parásitos se inició hace 13 años, y ha desarrollado proyectos con financiación nacional e internacional. Como resultado de este trabajo, se han obtenido 57 publicaciones internacionales de alto factor de impacto y se han formado 6 investigadores en maestría y 1 en doctorado.

 

 

Director de la línea:

Manuel Alfonso Patarroyo Gutierréz, MD., Dr.Sc.

 

 

Línea de Modificación de Antígenos y su Efecto en la Respuesta Inmune del Hospedero

 
El objetivo de esta línea de investigación es estudiar el efecto funcional en la respuesta inmune humoral al modificar antígenos selectos de parásitos como el Plasmodium falciparum (agente causal de la malaria).

 

 

Este tipo de modificaciones de origen químico realizadas en lugares estratégicos de la estructura primaria de un antígeno, como puede ser la cadena lateral de un residuo en particular (modificación estereoquímica) o en un enlace peptídico específico (modificación topoquímica) constituyen la base del diseño de tales moléculas. La línea cuenta con la experticia de profesionales que aplican sus conocimientos al desarrollo de antígenos modificados y la producción de anticuerpos policlonales y monoclonales frente a estos.

 

 

La generación de hibridomas reactivos productores de inmunoglobulinas y el manejo de cultivos y líneas celulares permiten la obtención de nuevas herramientas moleculares para la dilucidación de posibles nuevos mecanismos de respuesta frente a un antígeno caracterizado estructuralmente mediante ensayos in vitro e in vivo.

 

 

En los últimos 15 años se han desarrollado varios proyectos de investigación a partir de los cuales se ha generado una gran cantidad de información publicada en 30 artículos en revistas internacionales indexadas de alto factor de impacto.

 

 

También se ha formado recurso humano calificado, como son tres Magísteres y tres Doctores en Ciencias Químicas, un profesional en ciencias de la salud que realizó su servicio social obligatorio, y un importante número de jóvenes investigadores provenientes de los diferentes programas de pregrado de universidades públicas y privadas.

 

 

Investigador principal:

José Manuel Lozano Moreno,Q, PhD.

 

 

Línea de Relación Estructura-Función en la Búsqueda de Vacunas Sintéticas

 

El objetivo de esta línea de investigación es descifrar reglas matemáticas que permitan la modificación de antígenos candidatos a vacuna antimalárica contra Plasmodium falciparum, de modo que induzcan una fuerte y duradera respuesta inmune protectiva contra esta enfermedad.

 

 

 Dentro de los diferentes subproyectos que están en curso para lograr el objetivo, se encuentran:

 

• Síntesis química de péptidos con base en la secuencia primaria de antígenos de Plasmodium falciparum.
• Estudio de las interacciones moleculares entre los antígenos parasitarios y sus receptores en la célula hospedera.
• Evaluación de la respuesta inmune humoral y celular generada en monos Aotus spp. ante la inoculación de los candidatos vacunales.
• Estudio de la estructura tridimensional de los candidatos vacunales nativos y modificados.
• Análisis molecular de la interacción entre los candidatos vacunales nativos y modificados con las moléculas del Complejo Mayor de Histocompatibilidad Clase II.

 

Esta línea de investigación se desarrolla desde hace 27 años y en ella se han formado 18 Doctores y 17 Magísteres. Uno de los resultados más prominentes fue el desarrollo de la SPf66: la primera vacuna químicamente hecha y la primera contra la malaria.

 

De esta línea se han obtenido cerca de 300 publicaciones científicas internacionales de alto factor de impacto. El grupo de investigación cuenta con 70 investigadores de tiempo completo.

 

 

Investigador principal:

Profesor Manuel Elkin Patarroyo Murillo, M.D.

 

 

Línea de Biología Molecular y Bioquímica de Micobacterias

 
El objetivo de la línea es identificar nuevos antígenos candidatos a vacuna contra Mycobacterium tuberculosis. Para lograr este objetivo, se vienen desarrollando los siguientes subproyectos:

 

 

 Dentro de los diferentes subproyectos que están en curso para lograr el objetivo, se encuentran:

 

• Desarrollo y aplicación de herramientas bioinformáticas específicas para microbacterias, con el fin de identificar proteínas secretadas y de superficie.
• Síntesis química de péptidos con base en la secuencia primaria de antígenos de Mycobacterium tuberculosis.
• Estudios de interacción del tipo receptor-ligando entre los antígenos de micobacteria y las células blanco.
• Clonaje y expresión de proteínas microbacterianas candidatas a vacuna.
• Estudios de respuesta inmune en modelo de ratón y cobayo.

 

Esta línea de investigación se ha desarrollado desde hace 20 años, durante los cuales se han generado más de 30 publicaciones en revistas internacionales de alto factor de impacto. En la actualidad se cuenta con 5 investigadores de tiempo completo, un Doctor en Ciencias Químicas, un Magíster en Biología Molecular y dos estudiantes de doctorado y maestría, respectivamente.

 

 

Investigadora principal:

Marisol Ocampo Cifuentes, Q., candidato a Ph.D